El genoma de su pez mascota es extremadamente extraño

Los humanos han domesticado una gran cantidad de animales a lo largo de su historia, algunos como alimento, otros como compañeros y protectores. Algunas especies, como animales como conejos y cobayas, se han desplazado parcialmente entre estas dos categorías, y actualmente sirven tanto como alimento como como mascotas. Pero una especie ha dejado atrás por completo su pasado como fuente de alimento. Y, en otra rareza, acabó sirviendo no tanto como acompañante sino como decoración.

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Estamos hablando de peces de colores aquí, y ahora hemos echado un vistazo a sus genoma. Y es casi tan extraño como los propios peces.

Vale la pena detenerse un momento para considerar cuán extraños son dentro del ámbito de la domesticación. Comenzaron como variantes ligeramente coloreadas de una carpa que, de lo contrario, se usa completamente para la acuicultura. Los hemos eliminado por completo de la cadena alimentaria y los hemos convertido en mascotas, pero no son el tipo de mascotas con las que interactuamos como un perro o un gato, o incluso un conejillo de indias. En general, simplemente se sientan allí y se ven decorativos. Y en el proceso de hacerlos aún más decorativos, hemos criado muchas variedades que son mucho menos funcionales que los peces.

También hay un poco de historia extraña aquí. Si bien los llamamos peces dorados de manera bastante genérica, la mayor parte de lo que tenemos no son los peces dorados reales. Después de su domesticación en China (y luego pasar de los estanques de jardín a los tanques interiores), los peces de color dorado terminaron reservados para el emperador, por lo que todavía son bastante raros. Mientras tanto, hemos creado cepas con múltiples colas, cepas que carecen de aletas dorsales y más.

Es probable que eso le haga algunas cosas raras a los peces, genéticamente. Pero resulta que eran bastante raros para empezar.

Incluso el proceso de informar sobre el genoma resultó ser algo extraño. Fue primero informó en mayo, cuando un grupo describió el genoma de un pez dorado y lo comparó con su antepasado, la carpa común. Pero el análisis fue bastante minimalista. Luego, esta semana, un gran consorcio lanzó un análisis no solo de una cepa de peces de colores sino de 185 cepas diferentes. Más 16 genomas de carpa salvaje diferentes para comparar. Si bien el genoma del pez dorado tiene solo 1.800 millones de pares de bases de largo (1.8 gaseas), la secuencia sin procesar requerida para hacer todo esto se extendió a 4.3 billones de bases. Es un esfuerzo asombroso.

Pero debido a que algún otro grupo ya publicó los datos, los investigadores los publicaron en PNAS utilizando una ruta que solo lo someta a una revisión informal por pares. No parece haber nada problemático con el artículo que pudiera hacer que falle la revisión por pares, pero los editores normalmente quieren resultados novedosos, y esto aparentemente no era lo suficientemente nuevo.

La mayoría de los animales tienen dos juegos de cromosomas similares, uno de su madre y uno de su padre. En los seres humanos, hay 23 cromosomas, y tenemos dos de cada uno, lo que significa que cada uno tiene 46 de ellos. Tanto en el pez dorado como en la carpa de la que se derivaron, hay 25 cromosomas, pero cada pez lleva 100 de ellos; en lugar de dos copias, tienen cuatro, o más bien dos conjuntos de dos. Aparentemente, el linaje que produjo la carpa es un híbrido de dos linajes estrechamente relacionados (posiblemente especies separadas pero estrechamente relacionadas).

En consecuencia, a menos que algunas copias de los genes hayan sido eliminadas o inhabilitadas por mutación, el pez debería tener cuatro copias de ellas. Pero hay algunos casos específicos en los que no lo hacen, como los genes de reparación del ADN, donde se ha eliminado un conjunto de copias. Y en muchos tejidos, uno u otro conjunto de genes es más activo, pero no hay un patrón obvio y consistente de cuál de los conjuntos es. Así que no estamos en el punto en el que realmente comprendamos lo que está sucediendo con los cuatro conjuntos de genes de los peces, pero la respuesta probablemente no sea simple.

Los peces se aislaron recientemente y se han sometido a una selección bastante seria de características inusuales; solo mira las imágenes en Wikipedia lista de cepas de peces de colores. Es probable que muchas de las variantes genéticas subyacentes a estos rasgos físicos sean recientes y se hayan seleccionado como la única variante presente en la cepa. Esto crea lo que se llama un “barrido selectivo” en el que la variante, y cualquier otra que esté cerca de ella cuando surgió, son las únicas presentes en una población.

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